El 5 de mayo de 2011 se firmó el Protocolo de Colaboración entre el Ministerio de Fomento y Gobierno Vasco para el desarrollo de las terminales logísticas intermodales incluidas en la red básica de mercancías del Plan Estratégico para el Impulso del Transporte Ferroviario de Mercancías.
En ese documento, el Gobierno Vasco consideraba necesario colaborar en el desarrollo de esas terminales con el fin de propiciar que el modo ferroviario y las infraestructuras ferroviarias tengan un mayor protagonismo en el transporte de mercancías. En el protocolo se recogía además que, para Júndiz y Lezo el Ministerio de Fomento y el Departamento de Vivienda, Obras Públicas y Transportes llevarían a cabo los estudios necesarios para evaluar su viabilidad logística y económica, así como para definir, en su caso, el modelo de promoción y gestión más adecuado.
El Departamento de Vivienda, Obras Públicas y Transportes será el responsable de la realización de los estudios relativos al encaje territorial y urbanístico de las terminales, así como aquellos referidos al mercado logístico. Estos estudios serán puestos a disposición del Ministerio de Fomento para que pueda desarrollar armonizadamente en plazos el proyecto conjunto para todo el Estado.
